벤, 얼음으로 뒤덮힌 남극대륙을 구하라!

평범한 소년 벤은 우주악당 빌객스의 최강무기 옴니트릭스를 갖게 된 후, 외계인으로 변신할 수 있게 된다. 슈퍼히어로로 맹활약하던 벤 일행은 어느 날 해저왕국 아틀란티스에서 온 소년 트리톤을 만나 위험에 빠진 아틀란티스를 구하기 위해 떠난다. 벤과 그웬, 맥스는 처음 보는 바다의 아름다움에 감탄하며 해저왕국에 도착하지만, 아틀란티스는 애니모 박사의 음모에 의해 큰 위기에 처하게 된다. 벤은 슈퍼히어로로 변신하여 애니모의 공격을 막아내지만, 애니모는 그 순간 그웬과 맥스 할아버지를 남극으로 납치해 가는데…!! 벤은 과연 옴니트릭스를 노리는 빌객스와, 남극을 위기로 몰아넣는 애니모를 다 막을 수 있을 것인가